Организационно приходы объединены в четыре епархии, вместе составляющие митрополию: Архиепархия Матери Божией в Москве; Преображенская епархия в Новосибирске, Епархия Святого Иосифа в Иркутске, Епархия Святого Климента в Саратове. Главой Римско-католической церкви (РКЦ) в России является архиепископ Паоло Пецци, носящий титул митрополита. 

Официальная позиция РКЦ состоит в том, что католицизм в России следует возрождать лишь для этнических католиков (поляков, немцев, литовцев, латышей). Но практика показывает, что в каждом из возрожденных католических приходов через несколько лет после его существования русские составляют большинство общины. Учитывая, что верующие католики в России принадлежат к разным национальностям и являются подданными различных государств, служение осуществляется на 13 языках. 

В 1992 году Папской комиссией Pro Russia был принят документ, в котором говорится, что «для содействия гармоничному сосуществованию с Православной церковью и в доказательство открытости, которой должна быть отмечена любая пастырская инициатива Католической церкви, епископы и апостольские администраторы должны информировать правящих епископов Православной церкви обо всех важных пастырских инициативах, в особенности об учреждении новых приходов, необходимых для духовного окормления католических общин, уже существующих на местах». В нем также рекомендуется уведомлять представителей Православной церкви о любой инициативе социального порядка (в том числе в области воспитательной и благотворительной деятельности). 

В Санкт-Петербурге действует Высшая духовная семинария «Мария – Царица Апостолов», в Москве религиозным и гуманитарным образованием занимается Институт философии, теологии и истории св. Фомы. Выходят две радиопрограммы: «Радио дар» – в Москве и «Радио Мария» – в Северной столице. В 1994 году по инициативе епископа Преображенской епархии Иосифа Верта была основана Сибирская католическая телестудия «Кана». Она готовит еженедельную часовую программу, содержащую новости, репортажи из приходов, информацию о деятельности Римского Папы, фильмы религиозного содержания, интервью и музыкальные клипы на одном из новосибирских телеканалов.

Независимая газета